Der Hafen von Palermo, um den sich die antike Stadt entwickelt hat, wird durch einen äußeren Wellenbrecher und einen inneren Kai (Südkai) geschützt, der mehrere große Kaianlagen und breite Wasserbecken umschließt. Die 270 Meter breite Hafeneinfahrt ist nach Südosten ausgerichtet und der Meeresboden ist schlammig und sandig mit einer Tiefe von 3 bis 5 Metern. Palermo ist der beste Ort, um einen Yachtcharter nach Ustica und an die Westküste Siziliens zu starten.